表观遗传学9787030737892兴海图书专营店 下载 pdf 百度网盘 epub 免费 2025 电子书 mobi 在线

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目录

第1章;;表观遗传学概论;;1

参考文献;;3

第2章;;DNA甲基化;;5

2.1;;DNA甲基化概述;;5

2.2;;DNA甲基化与细胞记忆机制;;7

2.3;;DNA甲基化模式的建立和维持;;8

2.4;;DNA甲基化在基因表达调控中的作用;;12

2.5;;DNA甲基化在哺乳动物中的主能;;16

2.6;;DNA甲基化与疾病;;19

2.7;;DNA甲基化相关问题与展望;;23

参考文献;;24

第3章;;DNA去甲基化;;28

3.1;;DNA去甲基化概述;;28

3.2;;TET概述;;35

3.3;;DNA去甲基化相关问题与展望;;42

3.4;;DNA去甲基化研究面临的挑战;;44

参考文献;;45

第4章;;基因组印记;;51

4.1基因组印记概述;;51

4.2;;小鼠的印记基因;;56

4.3;;基因组印记的调控;;58

4.4;;印记基因群区的典型调控模型;;65

4.5;;基因组印记的正能;;67

4.6;;印记基因失常与人类疾病;;69

4.7;;基因组印记的起源化;;70

4.8;结与展望;;71

参考文献;;72

第5章;;基因剂量补偿和X染色体失活;;76

5.1;;别决定与基因剂量补偿的概述;;76

5.2;;哺乳类X染色体失活的发现与简介;;80

5.3;;X染色体失活的动物模型与分子机制;;84

5.4;;X染色体失活与人类疾病;;89

5.5;结与展望;;92

参考文献;;93

第6章;;组蛋白甲基化修饰;;100

6.1;;蛋白质甲基化研究小史;;100

6.2;;组蛋白甲基化酶的种类及催化的修饰类型;;101

参考文献;;111

第7章;;组蛋白去甲基化;;117

7.1;;组蛋白去甲基化动态调控的研究历史概述;;117

7.2;;组蛋白去甲基化酶的命名;;121

7.3;;组蛋白去甲基化酶的生物能;;123

7.4;;组蛋白去甲基化酶在制药领域的潜在应用;;127

参考文献;;129

第8章;;组蛋白乙酰化;;131

8.1;;组蛋白乙酰化的发现;;131

8.2;;组蛋白乙酰化酶及其复合物;;133

8.3;;组蛋白去乙酰化酶和剂;;138

8.4;;乙酰化识别蛋白;;143

8.5;;组蛋白乙酰化的作用机制能;;145

8.6;;组蛋白乙酰化与人体生理病理;;150

8.7;;组蛋白乙酰化修饰与研发;;152

8.8;;展望;;153

参考文献;;154

第9章;;组蛋白其他修饰与组蛋白变体;;162

9.1;;组蛋白其他修饰与组蛋白变体概述;;162

9.2;;组蛋白磷酸化修饰;;167

9.3;;组蛋白新型酰化修饰;;170

9.4;;基于质谱检测的组蛋白修饰鉴定与定量分析;;181

9.5;;组蛋白变体;;187

参考文献;;193

第10章;;组蛋白修饰识别;;6

10.1;;组蛋白修饰识别概述;;6

10.2;;组蛋白修饰识别的分子基础;;7

10.3;;组蛋白修饰识别的调控机制;;210

10.4;;组蛋白修饰识别的生物能;;212

10.5;;组蛋白修饰识别与染色质信号转导;;215

10.6;;组蛋白修饰识别因子的鉴定方;;218

10.7;;组蛋白阅读器靶向的研发;;2

参考文献;;222

第11章;;染色质重塑;;228

11.1;;染色质重塑概述;;228

11.2;;核小体定位与基因调控;;229

11.3;;组蛋白分子伴侣;;233

11.4;;染色质重塑复合体;;238

11.5;;染色质重塑与疾病;;243

参考文献;;244

第12章;;染色质结构与组蛋白变体;;247

12.1;;染色体结构;;247

12.2;;组蛋白变体;;254

参考文献;;261

第13章;;CTCF与三维基因组染色质结构;;265

13.1;;CTCF与DNA的相互作用;;265

13.2;;CTCF与黏连蛋白协同架构三维基因组染色质结构;;270

13.3;;CTCF与染色质结构;;272

13.4;;CTCF与基因表达调控;;275

13.5;结与展望;;283

参考文献;;285

第14章;;Polycomb复合物及Trithorax复合物;;289

14.1;;Polycomb复合物和Trithorax复合物概论;;290

14.2;;Polycomb复合物;;293

14.3;;Trithorax复合物;;302

14.4;;Polycomb复合物和Trithorax复合物相关剂;;308

14.5;结与展望;;309

参考文献;;310

第15章;;DNA甲基化修饰酶的结构生物学研究;;315

15.1;;DNA甲基转移酶;;315

15.2;;DNA去甲基化调控酶;;323

参考文献;;326

第16章;;非编码RNA;;330

16.1;;非编码RNA概述;;330

16.2;;非编码RNA种类;;332

16.3;;非编码RNA特征、产生及生物能;;332

16.4;;非编码RNA与疾病;;340

16.5;;研究非编码RNA的方法学;;342

16.6;结与展望;;344

参考文献;;345

第17章;;siRNA;;348

17.1;;RNAi概述;;348

17.2;;siRNA的加工生成;;349

17.3;;RNAi的调控机制;;353

17.4;;RNAi引起的毒副作用;;358

17.5;;RNAi的前景与挑战;;360

参考文献;;362

第18章;;RNAa;;365

18.1;;RNAa概述;;365

18.2;;外源RNAa;;368

18.3;;内源RNAa;;372

18.4;;线虫中的RNAa;;374

18.5;;RNAa的应用;;375

18.6;;RNAa领域面临的问题与展望;;376

参考文献;;376

第19章;;microRNA概述;;381

19.1;;miRNA的概况;;381

19.2;;miRNA的生物合成;;384

19.3;;miRNA的作用机制;;392

19.4;;miRNA数据库简介;;397

19.5;;miRNA能与疾病;;399

19.6;;miRNA与疾病诊断和;;410

参考文献;;414

第章;;NamiRNA;;423

.1;;miRNA概述;;423

.2;;子与miRNA的关系;;426

.3;;NamiRNA通过子介导基因的激活;;428

.4;;NamiRNA作用机制;;430

.5;;NamiRNA研究的展望与挑战;;431

参考文献;;434

第21章;;piRNA436

21.1;;piRNA的发现、分类与生成;;436

21.2;;piRNA通路能及作用机制;;440

21.3;;piRNA机器的代谢;;445

21.4;;piRNA与男不育;;445

21.5;结与展望;;446

参考文献;;446

第22章;;lncRNA;;447

22.1;;lncRNA的发现和定义;;447

22.2;;lncRNA的鉴定、种类与特征;;448

22.3;;lncRNA的表达与转录后加工;;451

22.4;;lncRNA的调控机制;;453

22.5;;lncRNA的生能;;459

22.6;;lncRNA与465

参考文献;;467

第23章;;环形RNA;;475

23.1;;环形RNA的发现;;475

23.2;;环形RNA的基本分类;;477

23.3;;环形RNA的自身代谢;;478

23.4;;反向剪接环形RNA的生物学特征;;481

23.5;;反向剪接环形RNA能;;483

23.6;;环形RNA与疾病;;485

23.7;;环形RNA研究展望;;486

参考文献;;486

第24章;;RNA修饰;;490

24.1;;RNA修饰简介;;490

24.2;;RNA修饰分布特征;;495

24.3;;RNA修饰的生物能;;500

24.4;;RNA修饰与生理病理效应;;505

24.5;结与展望;;510

参考文献;;511

第25章;;RNA编辑;;515

25.1;;RNA编辑概述;;515

25.2;;RNA编辑的分类;;516

25.3;;RNA编辑的定位和定量;;5

25.4;;动物中RNA编辑能;;521

25.5;;植物中RNA编辑能和意义;;532

25.6;;RNA编辑的应用;;536

25.7;结;;537

参考文献;;537

第26章;;DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA的互动与协调;;544

26.1;;DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA的相互关系和调控概论;;544

26.2;;DNA甲基化与组蛋白修饰;;546

26.3;;非编码RNA与DNA甲基化;;548

26.4;;非编码RNA与组蛋白修饰;;550

26.5;;DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA三者之间的悖论和挑战;;554

参考文献;;557

第27章;;表观遗传学与基因可变剪接;;561

27.1;;基因可变剪接能和生物学意义;;561

27.2;;基因可变剪接的经典调控;;565

27.3;;组蛋白修饰与基因可变剪接;;568

27.4;;DNA甲基化与基因可变剪接;;570

27.5;;研究展望;;572

参考文献;;573

第28章;;染色质的空间结构能学意义;;576

28.1;;细胞核与染色质的空间组织架构;;576

28.2;;解析染色质;;3D结构的方法;;581

28.3;;发育过程中动态变化的染色质结构;;584

28.4;;疾病情况下改变的染色质形态;;586

28.5;结与展望;;589

参考文献;;590

第29章;;子与细胞身份;;595

29.1;;子的概念与定义;;596

29.2;;子的表观遗传学特征;;596

29.3;;子序列变异及突变与疾病;;602

参考文献;;603

第30章;;表观遗传信息的遗传;;607

30.1;;表观遗传信息的遗传概述;;607

30.2;;表观遗传信息的跨代传递;;608

30.3;;有丝分裂中的基因书签;;615

30.4;结与展望;;623

参考文献;;625

第31章;;表观遗传与遗传的相互作用;;629

31.1;;SNP与基因表观遗传调控区域的关系;;629

31.2;;表观遗传修饰改变与拷贝数变异;;633

31.3;;唐氏综合征的表观遗传异常;;635

31.4;;遗传与表观遗传学共同决定人的状;;638

参考文献;;643

第32章;;表观遗传学与生殖;;649

32.1;;生殖过程概述;;649

32.2;;精子发生和成熟的表观遗传特征;;651

32.3;;卵子发生和成熟中的表观遗传调控;;662

32.4;;表观遗传异常与不孕不育;;666

32.5;结与展望;;668

参考文献;;668

第33章;;早期胚胎发育中表观遗传信息的传递、重编程和调控;;682

33.1;;引言;;682

33.2;;哺乳动物的配子发生和早期胚胎发育;;684

33.3;;表观遗传调控在胚胎发育中的重能;;686

33.4;;研究早期胚胎发育中表观遗传调控的方法;;689

33.5;;配子发生中表观基因组的建立;;691

33.6;;早期胚胎发育过程中的表观遗传重编程;;693

33.7;结与展望;;698

参考文献;;698

第34章;;表观遗传学与重编程;;707

34.1;;重编程概述;;707

34.2;;重编程过程中的表观遗传调控;;710

34.3;结与展望;;716

参考文献;;716

第35章;;表观遗传学与造血细胞分化及疾病;;718

35.1;;正常造血过程及表观遗传调控;;718

35.2;;造血分化异常疾病的表观遗传调控;;723

35.3;;表观遗传调控因子的相互作用;;734

35.4;;造血异常疾病的表观遗传调控;;736

35.5;结与展望;;741

参考文献;;742

第36章;;表观遗传与免疫细胞分化及自身免疫病;;747

36.1;;免疫细胞的发育和分化;;747

36.2;;DNA去甲基化与免疫基因激活;;749

36.3;;子对免疫细胞分化的调控;;750

36.4;;自身免疫疾病与DNA甲基化;;751

36.5;;组蛋白修饰与自身免疫疾病;;757

36.6;;miRNA与自身免疫疾病;;761

36.7;结与展望;;765

参考文献;;766

第37章;;表观遗传学与神经系统疾病;;781

37.1;;表观遗传学简介;;781

37.2;;神经发育疾病中的表观遗传学;;787

37.3;;神经退行疾病中的表观遗传学;;788

37.4;;针对表观遗传的潜在方法;;793

37.5;结与展望;;794

参考文献;;794

第38章;;表观遗传学与孤独症谱系障碍;;804

38.1;;孤独症谱系障碍;;804

38.2;;孤独症谱系障碍与环境因素;;808

38.3;;ASD中的典型基因突变;;809

38.4;;孤独症谱系障碍与基因组印记异常;;812

38.5;;ASD的表观遗传标志物;;814

38.6;结与展望;;816

参考文献;;816

第39章;;表观遗传与分子代谢;;819

39.1;;蛋白质翻译后修饰;;8

39.2;;代谢基因突变产生致癌代谢物;;822

39.3;;代谢与表观遗传研究所面临挑战;;828

39.4;结与展望;;832

参考文献;;832

第40章;;表观遗传与;;838

40.1;;的基本特征;;839

40.2;;与表观遗传;;845

40.3;结与展望;;863

参考文献;;864

第41章;;表观遗传学与人类复杂疾病;;867

41.1;;复杂疾病的遗传学;;867

41.2;;复杂疾病的表观遗传学机制;;871

41.3;结与展望;;876

参考文献;;879

第42章;;环境表观遗传学;;883

42.1;;环境毒素与表观遗传学变化;;883

42.2;;应对环境污染导致表观遗传变异的策略;;890

参考文献;;893

第43章;;表观遗传学与外泌体;;897

43.1;;微囊泡概念及分类;;897

43.2;;外泌体的生物生成;;897

43.3;;外泌体分泌;;900

43.4;;外泌体组成成分;;901

43.5;;外泌体摄取;;902

43.6;;外泌体的生能;;903

43.7;;外泌体的应用;;904

43.8;;外泌体的研究方法;;906

参考文献;;908

第44章;;表观遗传相关;;914

44.1;;表观遗传简介;;914

44.2;;表观遗传的发展现状;;917

44.3;;表观遗传先导化合物的研究现状;;923

44.4;;表观遗传发现的难点和策略;;928

44.5;;表观遗传的应用;;932

44.6;;表观遗传发展面临的挑战及展望;;935

参考文献;;937

第45章;;基因编辑技术与表观遗传调控;;940

45.1;;常见基因编辑方法概述;;940

45.2;;基因组编辑技术在表观遗传调控中的应用;;944

45.3;;基因编辑技术定向调控表观修饰的意义;;948

45.4;;基因编辑定向调控技术的挑战与展望;;948

参考文献;;949

第46章;;表观遗传分子标志物;;953

46.1;;表观遗传分子标志物的种类和特点;;953

46.2;;表观遗传分子标志物的实验评估;;956

46.3;;表观遗传分子标志物的临床应用;;958

46.4;;表观遗传分子标志物在液体活检中的运用;;962

46.5;结与展望;;966

参考文献;;967

第47章;;全癌标志物;;973

47.1;;研究的窘境;;973

47.2;;的异质与共;;975

47.3;;全癌标志物;;976

47.4;;全癌标志物的展望;;980

参考文献;;980

第48章;;DNA甲基化检测方法;;982

48.1;;DNA甲基化研究方法概述;;982

48.2;;全基因组整体甲基化水平测定;;982

48.3;;基于甲基化敏感的内切酶分析;;983

48.4;;基于免疫亲和反应分析法;;988

48.5;;基于亚硫酸氢盐转化的甲基化检测;;990

48.6;;DNA甲基化检测方法的选择;;999

参考文献;;1000

第49章;;DNA甲基化组数据的生物信息学分析;;1005

49.1;;DNA甲基化组数据类型概述;;1005

49.2;;数据分析流程;;1007

49.3;;相关前沿研究;;1011

49.4;结;;1011

参考文献;;1011

第50章;;染色质免疫共沉淀技术;;1014

50.1;;ChIP方.1015

50.2;;ChIP基本方法：ChIP-qPCR;;1015

50.3;;ChIP-on-chip;;1021

50.4;;ChIP-seq;;1024

50.5;;ChIP-exo1029

参考文献;;1033

第51章;;ChIP的生物信息学1035

51.1;;ChIP-seq数据概述;;1035

51.2;;单个ChIP-seq样本的预处理和下游分析;;1036

51.3;;来自相同细胞状态的多ChIP-seq样本整合分析;;1038

51.4;;跨细胞状态的ChIP-seq样本比较分析;;1039

51.5;;ChIP-seq数据分析的挑战与展望;;1040

参考文献;;1041

第52章;;lncRNA的检测及研究方法;;1043

52.1;;概述;;1043

52.2;能;;lncRNA的筛查;;1044

52.3;;lncRNA的鉴定;;1046

52.4;;lncRNA的表达检测;;1049

52.5;;lncRNA在基因组上的结合位点检测;;1050

52.6;;RNA-蛋白质相互作用的检测;;1051

52.7;;lncRNA自身的表达调控研究;;1053

52.8;结与展望;;1055

参考文献;;1056

第53章;;RNA分析;;1059

53.1;;RNA-seq测序数据比对;;1059

53.2;;RNA的定量;;1061

53.3;;差异表达基因分析;;1063

53.4;;其他RNA分析方法;;1065

参考文献;;1067

第54章;;RNA修饰的检测;;1070

54.1;;RNA修饰的类型;;1070

54.2;;RNA修饰的检测技术;;1072

参考文献;;1090

第55章;;RNA剪接的生物信息学;;1093

55.1;;RNA剪接的生物信息学概述;;1093

55.2;;可变剪接的预测方法;;1094

55.3;;可变剪接预测结果的应用;;1097

55.4;结与展望;;1098

参考文献;;1098

第56章;;3D基因组检测方法;;1102

56.1;;染色质3D结构研究的实验方法;;1102

56.2;;3D基因组学生物信息分析;;1122

参考文献;;1125

第57章;;单细胞测序技术;;1127

57.1;;单细胞测序技术的意义和发展;;1127

57.2;;单细胞分离技术;;1129

57.3;;单细胞全基因组扩增方法;;1131

57.4;;单细胞基因组测序;;1134

57.5;;单细胞转录组测序;;1135

57.6;;单细胞表观组测序;;1141

57.7;;单细胞多组学测序;;1147

57.8;结与展望;;1149

参考文献;;1150

第58章;;核小体定位分析;;1155

58.1;;核小体定位分析概述;;1155

58.2;;基于酶促切割DNA的方式;;1156

58.3;;基于酶促反应印迹的方式——NOMe-seq;;1157

58.4;;基于抗体富集的方式——H3ChIP-seq;;1159

58.5;;基于化学或者物理切割DNA的方式;;1159

参考文献;;1161

第59章;;蛋白质翻译后修饰的质谱分析;;1164

59.1;;生物质谱的原理和分析方法;;1164

59.2;;常见蛋白质翻译后修饰的质谱分析;;1171

59.3;;蛋白质及修饰的信息学分析;;1183

59.4;;展望;;1184

参考文献;;1184

第60章;;基因编辑方法学;;1188

60.1;;基因编辑技术原理;;1188

60.2;;ZFN技术;;1189

60.3;;TALEN技术;;1191

60.4;;CRISPR/Cas9技术;;1191

60.5;;其他类型的CRISPR核酸酶;;1192

60.6;;CRISPR/Cas9特异-检测脱靶的方法;;1192

60.7;;提高特异的方法;;1193

60.8;;设计sgRNA的网站;;1195

60.9;;基因敲除;;1195

60.10;;基因敲入;;1196

60.11;;纠正基因突变与引入点突变;;1197

60.12;;CRISPR/Cas9导入细胞的方法;;1198

60.13;;CRISPR/Cas9系统的其他几种应用;;1198

60.14;结与展望;;10

参考文献;;10

第61章;;二代测序样本制备策略;;14

61.1;;简介：NGS及文库构建的关键;;14

61.2;;NGS工作流程的基础：片段化、片段大小选择及测序方式;;15

61.3;;DNA文库制备;;17

61.4;;RNA文库制备;;18

61.5;;NGS文库构建的注意事项：偏倚、复杂、批次效应;;1210

61.6;;靶向测序和扩增子测序;;1212

61.7;;单细胞DNA测序;;1213

61.8;;单细胞RNA测序1214

61.9;;临床应用;;1216

61.10;;染色体免疫沉淀测序;;1218

61.11;;RNA免疫沉淀测序;;12

61.12;;甲基化DNA免疫沉淀;;1222

61.13;;甲基化测序;;1223

61.14;;SHAPE测序;;1225

61.15;;其他基于二代测序的应用;;1225

61.16;;三代测序系统;;1225

参考文献;;1225

第62章;;表观遗传学常用软件及网站介绍;;1231

62.1;;ENCODE计划和Roadmap计划的介绍;;1231

62.2;;表观遗传常用数据及软件资源介绍;;1236

62.3;;表观遗传常用软件;;1242

62.4;结与展望;;1245

参考文献;;1245

第63章;;人也序列;;1248

63.1;;人也序列概述;;1248

63.2;;人也序列作用机制及应用;;1249

63.3;结与展望;;1252

参考文献;;1252

后记;;1255

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